故事(shì)发生在东(dōng)京(jīng)八丈岛近海，这里建(jiàn)成了一座连(lián)接了全球(qiú)各地(dì)警方监(jiān)控(kòng)摄(shè)像(xiàng)的海洋设施“太平洋浮标”。在这座设施正式(shì)启动之前，为了与欧洲刑警组织管(guǎn)辖(xiá)的范(fàn)围(wéi)联网，世界(jiè)各国的IT工程师来到现(xiàn)场(chǎng)。而与此同(tóng)时，一项(xiàng)应(yīng)用(yòng)了人脸识(shí)别系统的“新(xīn)技(jì)术(shù)”的测(cè)试也在进行中…… 　　另一方面(miàn)，柯南和少年(nián)侦(zhēn)探团(tuán)在园子(zi)的招(zhāo)待下(xià)来到八丈岛赏(shǎng)鲸(jīng)。此时，柯南接到来自(zì)冲(chōng)矢昂(áng)（赤(chì)井(jǐng)秀(xiù)一）的电(diàn)话，被(bèi)告(gào)知欧洲刑警组织的成员在德(dé)国遭到琴酒(jiǔ)的杀(shā)害(hài)。为调(diào)查(zhā)真(zhēn)相(xiāng)，柯南偷偷混(hùn)进了前往“太平洋浮标”进行警备工作的黑田(tián)兵(bīng)卫(wèi)等(děng)警视(shì)厅(tīng)人员乘(chéng)坐(zuò)的警备艇(tǐng)中，进入(rù)设施内部(bù)。之后(hòu)，在为系统启动而稳(wěn)步(bù)展(zhǎn)开准(zhǔn)备工作的设施内，发生了案件(jiàn)——一名(míng)女(nǚ)性工程遭到黑衣组织的绑(bǎng)架(jià)，而她手中装(zhuāng)有某(mǒu)些(xiē)情报(bào)的U盘(pán)也落(luò)到了黑衣组织的手里。 　　海中传(chuán)来令人毛(máo)骨(gǔ)悚(sǒng)然的螺(luó)旋(xuán)桨声(shēng)。而此时身在八丈岛的灰(huī)原(yuán)哀(āi)身边(biān)，也正有黑影(yǐng)在悄悄靠(kào)近…