環境学者である西山玄学は、企業や企業の肩を持(chí)つ警察(chá)👮の圧(yā)力に屈(qū)することなく公害の実態調査をする一方、代々家に伝わる『諸(zhū)世紀』の研究をしていたそんな或(huò)る日、娘であるまり子の恋(liàn)人の中川が帰(guī)国。まり子と中川の前(qián)で、父(fù)の西山玄学は「今(jīn)の時(shí)代、先がどうなるかわからない。結婚(hūn)しても子供は作(zuò)るな」と残(cán)酷(kù)な忠告をした。数(shù)日後(hòu)、夢(mèng)の島で合成防(fáng)腐剤(jì)AF2のため巨大化したナメクジが大発生する。日本各地では奇形(xíng)児(ér)が増加する一方で、亜鉛(qiān)鉱(kuàng)山周(zhōu)辺(biān)では特(tè)定の能力が異常に発達した子供が現れる。中川の実家がある漁(yú)村(cūn)が赤(chì)潮(cháo)で全滅した夜(yè)、中川とまり子は互いに惹かれ、ついに船(chuán)の上で結ばれる。　　西山は、人類の行き過ぎた開発が人類を滅亡させるとして、必(bì)要(yào)以(yǐ)上の生産を止めるよう提言(yán)するが、人々の興味(wèi)は生活(huó)の向上や生産の増加に向いており、逆(nì)に「ヒューマニズムの崩(bēng)壊」と批(pī)判される始末(mò)。国際会議(yì)も、発展途上国の人口増加が環境破壊に拍(pāi)車(chē)をかけていると主張する先進国と、先進国の資源(yuán)浪(làng)費(fèi)が環境破壊の原因(yīn)だと反論する発展途上国が対(duì)立して紛(fēn)糾(jiū)する。そんな中、太(tài)平洋(yáng)上の海(hǎi)面(miàn)が凍りつき、エジプトで雪(xuě)が降るなどの異常気象が発生。さらに、成層圏(quān)に滞(zhì)留した放射能がニューギニアに降り注いだとの知(zhī)らせが届き、国際合同調査隊が派遣されることになった。西山の研究所(suǒ)からも2人の部下が派遣される。しかし合同調査隊は行方不(bù)明になり、西山や中川らによる第2次合同調査隊が派遣された。そこで彼らが目の当たりにしたのは、放射能によって巨大化した動植物(wù)や、食人鬼(guǐ)となり襲(xí)いかかる原住(zhù)民(mín)、そして洞窟(kū)の奥(ào)で生きる屍と化した第1次調査隊隊員の姿(zī)であった。彼らに拳銃(chòng)を向ける外国人隊員を制(zhì)止する玄学だが、「こうするほかに何(hé)ができますか」と反論された玄学も、自ら自分(fēn)の部下を射殺(shā)するしかなかった。　　その頃、SST事故(gù)によるオゾン層の破壊で日本列島に超(chāo)紫外線(xiàn)が降り注ぎ、山火(huǒ)事やコンビナートの炎上が続(xù)発。さらに、異常気象は世界(jiè)各地に拡(kuò)大し、各国の穀(gǔ)倉地帯(dài)は軒(xuān)並(bìng)み全滅。暴騰(téng)する食料価格や大災害で人心(xīn)は荒廃し、食料目当ての暴動や若(ruò)者の退(tuì)廃が進行。ついにそれによる二(èr)次災害までが発生し、東(dōng)京の空(kōng)はオゾン層の歪(wāi)みで巨大な鏡(jìng)と化した。大災害が頻(pín)発する中、西山の妻である伸(shēn)枝は病(bìng)に倒(dào)れ、玄学の腕に抱(bào)かれながら息(xī)を引(yǐn)き取る。その一方で、まり子の体(tǐ)には新(xīn)しい命(mìng)が宿(sù)っていた。　　度重(zhòng)なる天(tiān)変地異に、西山は国会で様(yàng)々な人類滅亡のパターンを警告し地球(qiú)の危機(jī)を力説、破滅への展望(wàng)を展開していく。その凄(qī)惨(cǎn)な内容(róng)に衝(chōng)撃を受(shòu)けた内閣(gé)総(zǒng)理大臣は、政治(zhì)家として大きな決断を迫(pò)られた。その決断とは…。